雨水收集后的處理過程，與一般的水處理過程相似。不同的是雨水的水質明顯比一般的回用水水質好。其處理流程為:屋面雨水—初期棄流—貯水池—清水池—沖洗、綠化等。
2、初期棄流
    屋面雨水污染物主要來源為屋面材料分解、大氣中的沉積物和天然降水。由于屋面徑流雨水經常表現出初期沖刷效應，初期徑流雨水中污染物濃度較高，水質混濁，隨著降雨的持續，一旦沖刷效應完成，徑流雨水的水質將明顯提高，所以要對初期雨水采用棄流措施。
3、貯水池
    貯水池是整個雨水回收系統的主要構筑物，它不僅起到屋面雨水收集的作用，同時也起到調節、沉淀作用。設計降雨量應根據工程所在地多年降雨統計資料和雨水利用工程投資規模、水量平衡等多重因素來合理確定。據了解，貯水池目前普遍使用的都是pp雨水收集模塊，即簡單又環保。
4、清水池
    清水的回用需要水泵提升。小規模的雨水回用一般是采用潛水提升泵,潛水泵可設在清水池內。一般的沖廁、綠化澆灌、地面沖灑、露天觀賞性水景等用水的水質要求不高。
    雨水的使用，在未經過妥善處理前（如消毒等），一般建議用于替代不與人體接觸的用水（如衛生用水、澆灌花木等）為主。也可將所收集下來的雨水，經處理與儲存的過程后，用水泵將雨水提升至頂樓的水塔，供廁所的沖洗使用。另外，如與人接觸的用水，仍以自來水供應。   
    雨水除了可以作為街廁沖洗用水外，也可作為其它用水如空調冷卻水、消防用水、洗車用水、花草澆灌、景觀用水、道路清洗等均可使用，此外，也可以經處理消毒后供居民飲用。